17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1676 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.991452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  370  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  48.86 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  48.26 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  47.67 
 
 		 176 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  47.67 
 
 		 176 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  49.43 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  46.55 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  47.16 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  46.82 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  46.55 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  47.59 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  45.66 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  44.25 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3151  hypothetical protein  55.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  34.92 
 
 		 247 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  31.88 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>