25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6538 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  98.3 
 
 
176 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  98.3 
 
 
176 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  81.18 
 
 
180 aa  293  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  72.35 
 
 
181 aa  265  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  71.18 
 
 
181 aa  260  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  69.32 
 
 
181 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  70.35 
 
 
179 aa  253  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  68.6 
 
 
186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  53.89 
 
 
187 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  56.07 
 
 
176 aa  183  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  54.34 
 
 
176 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1676  hypothetical protein  48.26 
 
 
185 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.991452  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2009  hypothetical protein  48.26 
 
 
176 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  40.98 
 
 
227 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  40.98 
 
 
225 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  40.98 
 
 
233 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  40.98 
 
 
233 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  40.98 
 
 
233 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  40.98 
 
 
229 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3151  hypothetical protein  60 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512095  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  39.34 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  27.78 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  24.42 
 
 
224 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  36.84 
 
 
221 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>