23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1475 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  70.95 
 
 		 181 aa  266  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  68.72 
 
 		 180 aa  253  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  70.35 
 
 		 176 aa  253  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  69.77 
 
 		 176 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  69.77 
 
 		 176 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  66.48 
 
 		 181 aa  248  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  68.18 
 
 		 186 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  65.92 
 
 		 181 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  54.19 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  52.51 
 
 		 176 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  46.99 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1676  hypothetical protein  44.25 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.991452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2009  hypothetical protein  44.25 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3151  hypothetical protein  61.11 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  36.07 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  34.43 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  34.43 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  34.43 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  34.43 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  27.59 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>