28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0030 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  83.98 
 
 		 181 aa  322  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  80.66 
 
 		 181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  74.71 
 
 		 186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7232  hypothetical protein  74.12 
 
 		 180 aa  271  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106534 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  69.89 
 
 		 176 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  69.89 
 
 		 176 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  69.32 
 
 		 176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  65.92 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  51.16 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  49.42 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1883  hypothetical protein  47.78 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1676  hypothetical protein  47.16 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.991452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2009  hypothetical protein  47.16 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  36.7 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  35.78 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  35.78 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  35.78 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  35.78 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  35.14 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  34.86 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  30.58 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3151  hypothetical protein  48 
 
 		 88 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  30.47 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  40.3 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  28.35 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  27.52 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  29.09 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>