34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6306 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  54.95 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  58.56 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  55.86 
 
 		 223 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  40.91 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  33.65 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  35.45 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  32.21 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  41.14 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  41.14 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  39.77 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  39.77 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  39.77 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  38.07 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  28.96 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  31.7 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  27.8 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  33.19 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  27.83 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  36.16 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  34.27 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  28.95 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  36.62 
 
 		 110 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2143  hypothetical protein  32.5 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  hitchhiker  0.000758409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  41.07 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  26.61 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  27.52 
 
 		 181 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1622  hypothetical protein  34.78 
 
 		 290 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2122  hypothetical protein  38.89 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1475  hypothetical protein  27.59 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106869  normal  0.29904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  39.29 
 
 		 176 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  26.61 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>