23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5783 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  29.95 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  29.41 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  32.32 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  26.17 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  34.27 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  30.27 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  35.04 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  28.11 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  36.21 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  35.34 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  35.34 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  35.34 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  35.34 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  30.3 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  31.76 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  32.77 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  30.43 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  32.48 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  28.24 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  23.67 
 
 
217 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>