28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6067 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  46.6 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  43.44 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  43.44 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  40.91 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  35.85 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  38.37 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  37.93 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  37.71 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  37.71 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  37.71 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  38.37 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  38.37 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  32.98 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  39.5 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  37.01 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  28.74 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  30.12 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  28.92 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  30.91 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  30.82 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  29.82 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  37.29 
 
 		 176 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2123  hypothetical protein  33.82 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2124  hypothetical protein  36.73 
 
 		 112 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0349  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>