34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1893 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  76.58 
 
 		 224 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  67.71 
 
 		 224 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  55.86 
 
 		 223 aa  238  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  43.44 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  36.36 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  39.44 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  44.59 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  35.4 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  44.51 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  43.59 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  43.59 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  43.59 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  42.13 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  44.59 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  43.95 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  33.68 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  34.33 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  30.4 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  31.51 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  30.6 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  32.77 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2143  hypothetical protein  29.35 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  28.35 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0667  hypothetical protein  25.98 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0030  hypothetical protein  28.35 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2122  hypothetical protein  37.7 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  31.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6054  hypothetical protein  27.78 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1991  hypothetical protein  27.67 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5690  hypothetical protein  27.78 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6538  hypothetical protein  27.78 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249848  normal  0.171838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2966  hypothetical protein  28.89 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>