31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3276 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3276  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1333  hypothetical protein  77.63 
 
 		 244 aa  357  9e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0927403 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5793  hypothetical protein  32.2 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1893  hypothetical protein  34.33 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5796  hypothetical protein  33.17 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0628742  normal  0.659893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3669  hypothetical protein  33.76 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0786  hypothetical protein  35.8 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0778628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6306  hypothetical protein  33.19 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0424149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4154  hypothetical protein  34.59 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3903  hypothetical protein  34.51 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3447  hypothetical protein  34.31 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0926  hypothetical protein  35.07 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3814  hypothetical protein  34.53 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4520  hypothetical protein  37.61 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5497  hypothetical protein  35.56 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4786  hypothetical protein  35.56 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3581  hypothetical protein  35.56 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4693  hypothetical protein  35.11 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.984437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4171  hypothetical protein  34.35 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6067  hypothetical protein  30.91 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4751  hypothetical protein  43.75 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5783  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4762  hypothetical protein  32.53 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6856  hypothetical protein  38.67 
 
 		 110 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2122  hypothetical protein  42.37 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.676544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4917  hypothetical protein  41.27 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1676  hypothetical protein  34.92 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.991452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2009  hypothetical protein  34.92 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2638  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4398  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.974823  normal  0.0874861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3249  hypothetical protein  48.48 
 
 		 232 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444446  hitchhiker  0.000758409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>