37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1697 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  100 
 
 
445 aa  889    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  57.21 
 
 
416 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
455 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  46.62 
 
 
448 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  48.83 
 
 
435 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  35.7 
 
 
426 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  34.99 
 
 
426 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  34.99 
 
 
426 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  34.99 
 
 
426 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  34.99 
 
 
426 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 
421 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  35.42 
 
 
426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  31.52 
 
 
452 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
446 aa  216  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  30.57 
 
 
430 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  29.15 
 
 
408 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
415 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  29.84 
 
 
453 aa  177  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.37 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  33.33 
 
 
409 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  28.48 
 
 
506 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  25.65 
 
 
425 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  29.01 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
400 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  29.12 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  29.12 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
420 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  23.94 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  23.41 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  28.26 
 
 
466 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 
408 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  27.22 
 
 
502 aa  43.9  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  31.25 
 
 
462 aa  43.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  28.57 
 
 
428 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>