25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0108 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  893    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  54.79 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  48.67 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  42.57 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  42.18 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  42.18 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  42.18 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  42.18 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  42.18 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  40.23 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  37.31 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  34.05 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 415 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  34.18 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  31.52 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  29.29 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 455 aa  216  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  21.29 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  21.11 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  21.27 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  21.27 
 
 		 433 aa  43.5  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>