30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 453 aa  877    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  45.01 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 446 aa  266  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 421 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 428 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  33.33 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  33.18 
 
 		 426 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  33.18 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  33.18 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  33.18 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  33.18 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  31.98 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  30.52 
 
 		 448 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  29.81 
 
 		 416 aa  192  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  29.84 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  27 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  36.54 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  27.8 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.77 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.1 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  27.03 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  25 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  25 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>