42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3129 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  76.41 
 
 		 428 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  827    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  56.7 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  56.83 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  56.83 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  56.83 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  56.83 
 
 		 426 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  56.1 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  43.88 
 
 		 430 aa  338  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 446 aa  305  8.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  40.1 
 
 		 435 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  38.9 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 415 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  35.98 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  35.4 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  36.06 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  34.64 
 
 		 453 aa  226  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  24.55 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  31.32 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.58 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  28.78 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.06 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  28.78 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  28.78 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  28.78 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  26.71 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  28.06 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  26.29 
 
 		 435 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  25.89 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>