49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  100 
 
 		 430 aa  832    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  48.89 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  42.28 
 
 		 426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  42.04 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  42.04 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  42.04 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  42.11 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  42.04 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  45.01 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  38.61 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  35.84 
 
 		 448 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 415 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  35.26 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  30.34 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  31.78 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  22.86 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  26.39 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  23.71 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  28.57 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  27.36 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  23.71 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  33.03 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  32.82 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 462 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  32.82 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>