54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1699 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1699  putative permease  100 
 
 
416 aa  837    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  57.21 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  51.95 
 
 
448 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  53.38 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  51.46 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  35.77 
 
 
426 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  35.52 
 
 
426 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  35.52 
 
 
426 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  35.52 
 
 
426 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  35.52 
 
 
426 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  35.52 
 
 
426 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
421 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  29.29 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  33.15 
 
 
408 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  30.34 
 
 
430 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
415 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  29.81 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  21.79 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  27.72 
 
 
495 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  24.47 
 
 
462 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  27.45 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  24.88 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  26.24 
 
 
458 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  24.88 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  24.88 
 
 
420 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  23.2 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.04 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  26.46 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  27.89 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  27.23 
 
 
504 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  24.88 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  25.91 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  31.5 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  25.62 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  25.91 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  25.91 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  26.58 
 
 
522 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  29.56 
 
 
459 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  25.58 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2601  major facilitator transporter  23.76 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602564  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
385 aa  43.9  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 
490 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  24.39 
 
 
413 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>