32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4716 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  100 
 
 
408 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  41.62 
 
 
426 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  41.12 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  41.12 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  41.12 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  41.12 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  41.12 
 
 
426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
428 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
415 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 
446 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  34.18 
 
 
452 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  33.15 
 
 
416 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  35.26 
 
 
430 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  31.57 
 
 
448 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  34.09 
 
 
435 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  29.15 
 
 
445 aa  192  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
455 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  27 
 
 
453 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  22.3 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  22.3 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  22.3 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  20.68 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.77 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  25.07 
 
 
432 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  25 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  33.78 
 
 
411 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>