35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3506 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  843    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  76.41 
 
 		 421 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  55.05 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  55.29 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  55.29 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  55.29 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  55.29 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  55.29 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  44.12 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  40.75 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 446 aa  315  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  38.37 
 
 		 448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  39.69 
 
 		 408 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  36.34 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  35.95 
 
 		 445 aa  242  7.999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  36.41 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0315  dicarboxylic acid transporter PcaT  28.67 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  28.37 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  25.36 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02810  dicarboxylic acid transporter PcaT  28.67 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0897596  hitchhiker  0.00833984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  28.37 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  28.37 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  28.37 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  28.37 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  27.66 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  31.43 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  25.19 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>