41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20300 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16580  major facilitator superfamily protein  80.92 
 
 		 448 aa  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20300  major facilitator superfamily (MFS) permease  100 
 
 		 435 aa  861    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1699  putative permease  51.46 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2472  major facilitator superfamily MFS_1  53.14 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00022569  normal  0.0159414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1697  arabinose efflux permease  49.03 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0820607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3506  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.832683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0298  alpha-ketoglutarate permease  38.31 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000251156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2510  alpha-ketoglutarate permease  38.22 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2525  alpha-ketoglutarate permease  38.22 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000638024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2331  alpha-ketoglutarate permease  38.22 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  37.98 
 
 		 426 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2294  alpha-ketoglutarate permease  38.2 
 
 		 426 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.05412e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3129  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3140  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.204042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32050  nitrate/nitrite transporter  38.61 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531313  normal  0.358541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0970  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 415 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4716  alpha-ketoglutarate permease  34.09 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29830  arabinose efflux permease family protein  31.83 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 491 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  21.89 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  24.04 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.2 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.2 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  22.56 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>