More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0211 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0211  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
90 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  92.31 
 
 
299 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  92.31 
 
 
299 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  92.31 
 
 
299 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  92.31 
 
 
299 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  92.31 
 
 
299 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  91.03 
 
 
299 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  88.46 
 
 
299 aa  144  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 
298 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
300 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
300 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
300 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 
276 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 
300 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 
300 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  44.3 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  43.06 
 
 
285 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.19 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 
279 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 
300 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3144  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
243 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  38.36 
 
 
294 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  35.96 
 
 
308 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
284 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
279 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 
295 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 
295 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
281 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
280 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
315 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 
279 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  32.93 
 
 
279 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
288 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 
293 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 
281 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 
515 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  42.65 
 
 
287 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 
283 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 
277 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 
288 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  36 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  36 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
290 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 
287 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 
271 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 
286 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
290 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  36.62 
 
 
288 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
288 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  36.62 
 
 
288 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 
513 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
290 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 
232 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
289 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  41.54 
 
 
288 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  31.94 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
294 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  31.94 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
301 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
292 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
290 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
279 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  34.62 
 
 
299 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
290 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
287 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 
283 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  31.94 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  31.94 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  31.94 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  42.11 
 
 
255 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
290 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  35.14 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  39.71 
 
 
288 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 
519 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 
314 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
289 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>