179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7693 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7693  putative Holo-acyl carrier protein synthase  100 
 
 
85 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17737  normal  0.391067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.67 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.32 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  54.69 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.4 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.1 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.65 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0668  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.33 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.19 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0624  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.45 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0738758  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.67 
 
 
117 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.75 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.25 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.87 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.3 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1139  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.75 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555231  normal  0.266624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.54 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.95 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3084  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.33 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.879901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  45 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.65 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  42.86 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.59 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.84 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.57 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2604  holo-acyl-carrier-protein synthase  44 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583944  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.71 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07360  phosphopantethiene--protein transferase  49.23 
 
 
117 aa  53.9  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289254  normal  0.262164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.27 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1391  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.85 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.67 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.24 
 
 
126 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  44.59 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.85 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.54 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.67 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09407  Fatty acid synthase, alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78615]  42.67 
 
 
1860 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00116938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.84 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03403  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.54 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.109163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.54 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.54 
 
 
125 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  42.67 
 
 
122 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.33 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.33 
 
 
122 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.1 
 
 
129 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.05 
 
 
140 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.45 
 
 
136 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  44.59 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.14 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.85 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.96 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.19 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.19 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2620  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.25 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117556 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.49 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.87 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0264  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.93 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000232324  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.89 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.66 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.36 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.28 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.19 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.1 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.1 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1885  holo-acyl-carrier-protein synthase  45.33 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00392321  normal  0.11013 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1596  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.36 
 
 
115 aa  48.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0620  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.67 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.151819  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1283  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.36 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329256 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1642  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  35.53 
 
 
131 aa  48.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00164827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2911  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.86 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297723  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1408  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.36 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.06 
 
 
126 aa  48.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.88 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  42.68 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.1 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16740  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.56 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.16 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80966  Fatty acid synthase subunit alpha Includes: Acyl carrier 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (Beta-ketoacyl reductase) 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (Beta-ketoacyl synthase)  43.24 
 
 
1880 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.507554  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.33 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.31 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.36 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.92 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.33 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.03 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
134 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0984  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.96 
 
 
116 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709677  hitchhiker  0.00323316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.92 
 
 
133 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.16 
 
 
134 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.56 
 
 
135 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 
126 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  37.84 
 
 
126 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>