104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3535 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  83.1 
 
 
221 aa  313  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  63.98 
 
 
218 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  63.37 
 
 
259 aa  257  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  60.31 
 
 
230 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  51.53 
 
 
215 aa  194  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.15 
 
 
208 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  49.26 
 
 
208 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.15 
 
 
217 aa  177  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  51.3 
 
 
222 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  51.11 
 
 
226 aa  174  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  53.4 
 
 
289 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.71 
 
 
219 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.73 
 
 
219 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  42.42 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50 
 
 
249 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.67 
 
 
255 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  38.42 
 
 
228 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  39.44 
 
 
255 aa  134  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.57 
 
 
270 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.65 
 
 
244 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.69 
 
 
231 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.43 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  29.27 
 
 
207 aa  115  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.49 
 
 
244 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3247  hypothetical protein  34.97 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3649  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.16 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.7 
 
 
253 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  33.66 
 
 
248 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2259  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.7 
 
 
233 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.57 
 
 
248 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.18 
 
 
275 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.74 
 
 
251 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.55 
 
 
248 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0494  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.69 
 
 
222 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308503  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2453  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.38 
 
 
248 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1528  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.17 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00536325  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.78 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  35.52 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2766  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.56 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.5 
 
 
286 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.49 
 
 
241 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.59 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.35 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  33.96 
 
 
236 aa  88.2  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.91 
 
 
198 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  33.51 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  35.03 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.65 
 
 
240 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.16 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2767  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.63 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.14 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27600  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.98 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.965799  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.51 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.84 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.66 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.32 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.16 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.46 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.59 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.73 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.73 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  31.79 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.25 
 
 
867 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.35 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2297  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.71 
 
 
150 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.06 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.32 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.36 
 
 
198 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.58 
 
 
248 aa  58.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.67 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.93 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.45 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  28.72 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  29.32 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.21 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  32.86 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  33.8 
 
 
137 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  33.8 
 
 
137 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.04 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.33 
 
 
232 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.53 
 
 
209 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  29.03 
 
 
200 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.64 
 
 
218 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.6 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.18 
 
 
523 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.08 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.18 
 
 
523 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.6 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.21 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  27.84 
 
 
190 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  23.5 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  32.09 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>