126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2304 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  58.49 
 
 
259 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  54.98 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50.87 
 
 
230 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  49.04 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  52.61 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.7 
 
 
219 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  48.56 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  52.81 
 
 
226 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.69 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  50.27 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  45.5 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.08 
 
 
208 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50.53 
 
 
289 aa  168  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.69 
 
 
222 aa  168  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.71 
 
 
219 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.84 
 
 
249 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  42.64 
 
 
228 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  40.78 
 
 
255 aa  145  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.45 
 
 
255 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.26 
 
 
231 aa  134  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.05 
 
 
248 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.79 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.56 
 
 
229 aa  131  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.22 
 
 
270 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.25 
 
 
244 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  39.22 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.93 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.2 
 
 
275 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  30.73 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2766  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.44 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3247  hypothetical protein  37.38 
 
 
234 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1528  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.69 
 
 
248 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00536325  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3649  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.17 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.86 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.56 
 
 
240 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2259  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40 
 
 
233 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0494  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  39 
 
 
222 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308503  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2453  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.14 
 
 
248 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  36.68 
 
 
200 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  40 
 
 
200 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  35.65 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.46 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2767  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
248 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.65 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.17 
 
 
251 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.93 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.47 
 
 
239 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.86 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.5 
 
 
286 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.13 
 
 
257 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27600  predicted dinucleotide-binding enzyme  35.14 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.965799  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.09 
 
 
198 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.38 
 
 
245 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  35.03 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.88 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.02 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.8 
 
 
199 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.74 
 
 
201 aa  85.1  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.81 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.87 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.31 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.29 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  32.78 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.39 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.02 
 
 
867 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  34.01 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2297  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.57 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.87 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.64 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.17 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.65 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.89 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.11 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.16 
 
 
316 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.91 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.4 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.12 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.42 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  27.06 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.74 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  31.58 
 
 
249 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.79 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.46 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.89 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  39.44 
 
 
137 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.99 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  39.44 
 
 
137 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.8 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.64 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2292  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.14 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159579 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  30.77 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.04 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  28.37 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.67 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>