77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7000 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
198 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  82.83 
 
 
198 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  84.34 
 
 
198 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  77.39 
 
 
200 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  77.39 
 
 
199 aa  284  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  76.38 
 
 
199 aa  283  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  75.88 
 
 
199 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  72.86 
 
 
199 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  60.61 
 
 
199 aa  235  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2292  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  60.23 
 
 
174 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  45.18 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  41.29 
 
 
200 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  41.8 
 
 
200 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.98 
 
 
198 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  36.14 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.89 
 
 
209 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.62 
 
 
199 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.5 
 
 
202 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.31 
 
 
201 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.35 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  32.45 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.57 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.51 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.28 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.13 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  36.07 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.42 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.73 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.38 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.26 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.89 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.31 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.02 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  32.35 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.52 
 
 
316 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  31.69 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.05 
 
 
219 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.69 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.35 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.72 
 
 
240 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  27.57 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.82 
 
 
257 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.94 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.34 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.38 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.94 
 
 
257 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.89 
 
 
289 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.11 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.25 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.52 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  29.05 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.69 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.95 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  32.43 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.21 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.89 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.24 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.75 
 
 
222 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.37 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.68 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.73 
 
 
239 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.73 
 
 
206 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.42 
 
 
249 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  26.32 
 
 
248 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.22 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.29 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.3 
 
 
243 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.11 
 
 
232 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.81 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.36 
 
 
289 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  40.58 
 
 
132 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>