50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3532 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  56.7 
 
 		 209 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  55.79 
 
 		 212 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50 
 
 		 222 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  47 
 
 		 215 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  55.21 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.48 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50.7 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  41.33 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.41 
 
 		 209 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  44 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.54 
 
 		 202 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  42.11 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  50.85 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.78 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  48.48 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  45.33 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  43.94 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.89 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  50 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.56 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.45 
 
 		 257 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.67 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.96 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  47.46 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.47 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  41.25 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  37.21 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  43.66 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.63 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.16 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.14 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.74 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  46.03 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.44 
 
 		 226 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.78 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.75 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.5 
 
 		 316 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.81 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  38.36 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.16 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.67 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.9 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.58 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.49 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.77 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.83 
 
 		 198 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  45.45 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  34.21 
 
 		 226 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.606867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>