132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1051 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0494  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  55.83 
 
 
222 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308503  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3649  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  56.31 
 
 
219 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  52.56 
 
 
244 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50.7 
 
 
248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  53.92 
 
 
229 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  49.77 
 
 
244 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  52.55 
 
 
270 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47.16 
 
 
248 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  49.75 
 
 
248 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  54.05 
 
 
253 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  49.49 
 
 
275 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2766  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  47.29 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2453  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.91 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1528  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.47 
 
 
248 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00536325  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2767  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  45.77 
 
 
248 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27600  predicted dinucleotide-binding enzyme  48.22 
 
 
246 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.965799  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3247  hypothetical protein  42.45 
 
 
234 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  43.6 
 
 
218 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  43.6 
 
 
219 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.71 
 
 
219 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.95 
 
 
259 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.2 
 
 
215 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.91 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  39.07 
 
 
208 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.22 
 
 
249 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  41.54 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.22 
 
 
230 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.92 
 
 
219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.67 
 
 
208 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.17 
 
 
217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2297  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  63 
 
 
150 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.11 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.06 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.19 
 
 
221 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.68 
 
 
213 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  33.89 
 
 
255 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  31.43 
 
 
207 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.76 
 
 
255 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.41 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.21 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  35.38 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.44 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.52 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  33.81 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.14 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  52.05 
 
 
137 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  52.05 
 
 
137 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.75 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.52 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.66 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.52 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.91 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.68 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.05 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.1 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.94 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.48 
 
 
198 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.55 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.35 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  31.82 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.36 
 
 
198 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.89 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4863  hypothetical protein  58.7 
 
 
85 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0738  hypothetical protein  58.7 
 
 
85 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  30.41 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.46 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.43 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.42 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.26 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.46 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.7 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.11 
 
 
199 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2259  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.87 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
316 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.87 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.85 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.28 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.32 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.49 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  30.39 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.73 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  28.8 
 
 
213 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  28.06 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1891  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  24.24 
 
 
345 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.81 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2249  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  26 
 
 
341 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0027514  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.09 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3475  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  23.19 
 
 
346 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.65 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4156  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  23.46 
 
 
346 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.82 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.21 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5606  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  33 
 
 
340 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.410608  hitchhiker  0.000556999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2511  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  27.2 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.12 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5371  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  29.85 
 
 
330 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4826  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  30.6 
 
 
330 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.104082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>