126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5816 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
244 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  59.67 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2766  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  59.31 
 
 
244 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  58.87 
 
 
248 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.94 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  49.17 
 
 
248 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.45 
 
 
275 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47.25 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50.22 
 
 
253 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2453  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  52.41 
 
 
248 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50.99 
 
 
231 aa  204  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2767  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  44.34 
 
 
248 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  49.07 
 
 
229 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27600  predicted dinucleotide-binding enzyme  45.26 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.965799  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1528  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.65 
 
 
248 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00536325  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3649  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47.28 
 
 
219 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0494  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  46.53 
 
 
222 aa  165  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308503  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3247  hypothetical protein  39.55 
 
 
234 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.18 
 
 
259 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.97 
 
 
208 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  36.74 
 
 
218 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  39.11 
 
 
220 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.44 
 
 
219 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  38.86 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.27 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.95 
 
 
208 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.59 
 
 
249 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.79 
 
 
215 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.17 
 
 
217 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.19 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.35 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  32.06 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.8 
 
 
226 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.38 
 
 
251 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.6 
 
 
289 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  31.8 
 
 
255 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.31 
 
 
221 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.82 
 
 
213 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  33.01 
 
 
236 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.3 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.58 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.15 
 
 
286 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.81 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2297  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47 
 
 
150 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.58 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  36.41 
 
 
228 aa  88.6  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.14 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.28 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  39.6 
 
 
137 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  39.6 
 
 
137 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.82 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.82 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.33 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.48 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.84 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.52 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  31.5 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.05 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.9 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.35 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.76 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  31.02 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.29 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.16 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4863  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0738  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  32.57 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.97 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.03 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.44 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.61 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.83 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.28 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.86 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.5 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.28 
 
 
199 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 
200 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.85 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.16 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.78 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.19 
 
 
205 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.1 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.89 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  28.09 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2259  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.52 
 
 
316 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  31.02 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.29 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  28.5 
 
 
208 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 
288 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.36 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.86 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.66 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03940  predicted dinucleotide-binding enzyme  23.43 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.942236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  31.25 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2350  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
332 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>