89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5537 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
198 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  85.35 
 
 
198 aa  341  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  84.34 
 
 
198 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  79.9 
 
 
199 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  79.4 
 
 
199 aa  290  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  77.39 
 
 
200 aa  289  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  79.4 
 
 
199 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  74.87 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  60.82 
 
 
199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2292  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  61.54 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  45.24 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  42.42 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  43.39 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.21 
 
 
198 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  39.68 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36 
 
 
215 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.8 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.59 
 
 
202 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  37.19 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.45 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.53 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  34.95 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.6 
 
 
259 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.97 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.2 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.73 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.87 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.28 
 
 
218 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.41 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.07 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.26 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.98 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  31.55 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.24 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.51 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.42 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.53 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.56 
 
 
316 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.97 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  34.43 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  32.06 
 
 
236 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  30.94 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.63 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.35 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.26 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.08 
 
 
289 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.73 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.51 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.62 
 
 
210 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.72 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.69 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.43 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.98 
 
 
257 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.87 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.46 
 
 
286 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.76 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  28.49 
 
 
248 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.65 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.78 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.82 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2766  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.91 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.98 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  30.41 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.06 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.22 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.17 
 
 
226 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.77 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  31.14 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3649  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.41 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.54 
 
 
248 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.98 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.18 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  30.4 
 
 
294 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.28 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.27 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.59 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.46 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.75 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  45 
 
 
132 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  28.98 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.86 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.82 
 
 
243 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.61 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  23.46 
 
 
255 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.06 
 
 
229 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.51 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.4 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>