135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3805 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.5 
 
 
202 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.4 
 
 
198 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  37.96 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  38.19 
 
 
200 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.65 
 
 
215 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.83 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.67 
 
 
198 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  33.16 
 
 
213 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.89 
 
 
201 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.19 
 
 
199 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.86 
 
 
209 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.38 
 
 
209 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.16 
 
 
199 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.57 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.47 
 
 
200 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.3 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.32 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.12 
 
 
257 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.29 
 
 
230 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2292  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.35 
 
 
174 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.28 
 
 
259 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.28 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  32.56 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.96 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  30.85 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.8 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.14 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  29.23 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.65 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  28.72 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.16 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.11 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.94 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.23 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.15 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.29 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  29.28 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.88 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.78 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.26 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  31.96 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.46 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.89 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  31.25 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.87 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.22 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  32.2 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.07 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.42 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  28.65 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.85 
 
 
248 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.25 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
316 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.86 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.28 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.65 
 
 
270 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.67 
 
 
286 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  30.41 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.35 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6638  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.21 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.35 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.03 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3649  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.64 
 
 
219 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.14 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  30 
 
 
231 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  28.09 
 
 
232 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.7 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.34 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  28.65 
 
 
226 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.84 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.07 
 
 
225 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.35 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.34 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.08 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.23 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  27.04 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.96 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  28.25 
 
 
248 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.04 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  31.85 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  28.42 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.68 
 
 
253 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.34 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.32 
 
 
220 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.91 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  30.46 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.77 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  30.34 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  26.67 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.82 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
309 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>