92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3964 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
220 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6638  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  46.26 
 
 
221 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.96 
 
 
223 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.5 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.68 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  33.49 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.85 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  29.9 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  35.38 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.46 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.96 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.17 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.5 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.92 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.41 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.86 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.8 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.2 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.84 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.18 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.35 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  32.82 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  32.98 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  34.9 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.94 
 
 
198 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.54 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.98 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.27 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  25.65 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  29.95 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.43 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.88 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  31.38 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.74 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.5 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  34.41 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.42 
 
 
257 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.27 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  29.81 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  32.76 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.97 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.69 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.9 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.61 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  31.58 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.27 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.14 
 
 
210 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.27 
 
 
226 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.02 
 
 
228 aa  52  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.26 
 
 
190 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  28.96 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.57 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  26.87 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.74 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  21.97 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.65 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.24 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.57 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.53 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.81 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.97 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  29.78 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  35.19 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.33 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.14 
 
 
190 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.46 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  27.57 
 
 
249 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 
287 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  27.66 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.33 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.69 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  29.35 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.22 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  25 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.1 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  32 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.97 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  27.59 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.61 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.43 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 
288 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  26.67 
 
 
216 aa  42  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.78 
 
 
248 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.5 
 
 
222 aa  42  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.27 
 
 
244 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  26.81 
 
 
312 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 
287 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>