88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1231 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 222 aa  429  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  42.79 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  41.74 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  38.74 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  39.63 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  37.79 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  30.49 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40.8 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.75 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.07 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  40.09 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.41 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  30.7 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.91 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  37.9 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  40.09 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  39.91 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  28.37 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  32.88 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  27.91 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  34.43 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.44 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  35.92 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  30.49 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  36.44 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  37.39 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.78 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  30.77 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  32.87 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  29.46 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.72 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  28.51 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  23.04 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  28.25 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  32.85 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  24.02 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  25.11 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  25.99 
 
 		 235 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.2 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  30.29 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.67 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  30.57 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.28 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.01 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.79 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.59 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.83 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.94 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  28.16 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.75 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  29.02 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.07 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.01 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.44 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.86 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.84 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.83 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.72 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.34 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.64 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.8 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.64 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.37 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.48 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  30.68 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.16 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  33.72 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.92 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.87 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.23 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.88 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.53 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.44 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  33.1 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.5 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  26.02 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  25.76 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.88 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.73 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  29.79 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.67 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  44.44 
 
 		 288 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 245 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.14 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1431  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.38 
 
 		 297 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>