94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0062 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 
244 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  48.23 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  44.3 
 
 
225 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  45.37 
 
 
222 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  40.43 
 
 
223 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  39.57 
 
 
223 aa  154  9e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  37.87 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  43.42 
 
 
226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  37.34 
 
 
222 aa  145  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.08 
 
 
223 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.74 
 
 
232 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  42.17 
 
 
222 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  42.98 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  44.3 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  42.54 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.15 
 
 
229 aa  121  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  40 
 
 
231 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  44.44 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  39.39 
 
 
232 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.35 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  39.44 
 
 
227 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  42.11 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  34.33 
 
 
220 aa  113  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  35.19 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  36.89 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  34.47 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.76 
 
 
242 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  33.91 
 
 
226 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  40.09 
 
 
222 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.98 
 
 
243 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  32.05 
 
 
216 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  38.72 
 
 
232 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.48 
 
 
235 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.04 
 
 
225 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  36.44 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  30.87 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.74 
 
 
205 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  28.38 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.96 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.48 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.81 
 
 
209 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  36.84 
 
 
222 aa  89  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.1 
 
 
225 aa  88.6  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  37.66 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.61 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.51 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  28.18 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.46 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.19 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.03 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.58 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  38.41 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.86 
 
 
316 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.56 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  32.2 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.86 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  29.55 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.17 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.39 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.93 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.97 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  31.94 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.42 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.23 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.81 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  26.7 
 
 
188 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.64 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.21 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.35 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.38 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.79 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.09 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.79 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.52 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  49.02 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.47 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.11 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.61 
 
 
190 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.67 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  28.68 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  30.71 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.89 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  23.87 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.78 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.82 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.04 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.04 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.47 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.58 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.65 
 
 
257 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>