73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4044 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  62.5 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  63.68 
 
 		 222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  41.52 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  44.3 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  42.22 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  43.5 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  38.14 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  42.48 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  41.33 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  40 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  37.67 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  33.81 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  38.25 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  38.77 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.91 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40.67 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  37.89 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  33.03 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  32.11 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.71 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.07 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.76 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  41.63 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  31.22 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  39.46 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.5 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  38.07 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  36 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  36.16 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  35.27 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.38 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  32.54 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  38.21 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  36.79 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  32.06 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.49 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.73 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.32 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.37 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.44 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.92 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  34.08 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.77 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  35.41 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.48 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.44 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.96 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.73 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  30.92 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.23 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.49 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.92 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  30.77 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.12 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.55 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.67 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.94 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.88 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.3 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.85 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.37 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  27.08 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 443 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1682  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.27 
 
 		 343 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0108781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.03 
 
 		 210 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.72 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  35.44 
 
 		 447 aa  41.6  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  23.53 
 
 		 439 aa  41.6  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>