65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4256 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  67.12 
 
 
222 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  62.5 
 
 
225 aa  280  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  40.17 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45.78 
 
 
232 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  45.29 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  43.42 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  43.69 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  42.86 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  45.33 
 
 
223 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  39.11 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  38.57 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  38.16 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  40.09 
 
 
222 aa  121  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  41.33 
 
 
231 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.16 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  42.67 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  43.24 
 
 
225 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.43 
 
 
229 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  32.43 
 
 
216 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.28 
 
 
223 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40 
 
 
222 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  40.62 
 
 
232 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  33.78 
 
 
216 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  39.35 
 
 
222 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  35.1 
 
 
225 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  42.27 
 
 
227 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  33.33 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  36.92 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  30.91 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  37.22 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  36.77 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.57 
 
 
229 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.81 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.08 
 
 
242 aa  89  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  38.29 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.43 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  32.68 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  36.28 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.15 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.19 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  37.02 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.16 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  36.49 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.98 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.09 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.49 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  34.67 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.36 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.33 
 
 
210 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.93 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.02 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.88 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.49 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  26.9 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  29.37 
 
 
209 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.29 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  34.38 
 
 
331 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.11 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.41 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.14 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  25.17 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.52 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.97 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>