126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0970 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  100 
 
 
232 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  81.58 
 
 
226 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  80.7 
 
 
223 aa  360  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  79 
 
 
231 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  78.64 
 
 
221 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  68.3 
 
 
222 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  70.4 
 
 
225 aa  284  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  63.44 
 
 
232 aa  278  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  67.69 
 
 
227 aa  275  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  68.04 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  65.04 
 
 
232 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  60 
 
 
231 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  57.01 
 
 
222 aa  205  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  50 
 
 
229 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  51.17 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  40.27 
 
 
223 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  39.82 
 
 
223 aa  148  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  38.46 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40.27 
 
 
223 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  40.36 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  45.78 
 
 
226 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  45 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  41.28 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  39.91 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  42.22 
 
 
225 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  38.54 
 
 
225 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  39.15 
 
 
220 aa  116  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  40.43 
 
 
244 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  42.29 
 
 
221 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.07 
 
 
222 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  38.68 
 
 
222 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  38.1 
 
 
222 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  47.17 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.97 
 
 
242 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.96 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  35.55 
 
 
216 aa  91.7  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  32.27 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  38.68 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  36.32 
 
 
222 aa  89  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.4 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.68 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  36.9 
 
 
200 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  38.94 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  31.78 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.66 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.84 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.5 
 
 
234 aa  79  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.21 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.82 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.23 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.04 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  37.17 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  38.76 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.02 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.08 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  33.81 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.67 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.29 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.29 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.35 
 
 
221 aa  62.4  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.62 
 
 
210 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.43 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.96 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.81 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.52 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.62 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.02 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  31.07 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  29.8 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.18 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  36.91 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.75 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.11 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.53 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  34.18 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.88 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.37 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  30.65 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.24 
 
 
198 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.88 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.1 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
447 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6638  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.17 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.92 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  32.82 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  32.39 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.64 
 
 
199 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.11 
 
 
225 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.89 
 
 
316 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.35 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  26.98 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.14 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  27.08 
 
 
439 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.8 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.61 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.78 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>