141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0718 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  100 
 
 
223 aa  427  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  52.05 
 
 
221 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  48.34 
 
 
226 aa  148  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  48.1 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  42.99 
 
 
222 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  47.64 
 
 
232 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  41.9 
 
 
225 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  42.92 
 
 
226 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  44.89 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  44.65 
 
 
222 aa  131  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  46.08 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  38.46 
 
 
222 aa  125  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  38.18 
 
 
223 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  38.64 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.4 
 
 
222 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  44.72 
 
 
227 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  39.09 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45.18 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40 
 
 
223 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  44.86 
 
 
225 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  44.29 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  40.18 
 
 
231 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  33.82 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  40.83 
 
 
232 aa  98.6  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  37.27 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  35.94 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  36.94 
 
 
222 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.44 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.11 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  35.27 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  29.3 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  30.7 
 
 
220 aa  85.1  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.99 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.67 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  30.56 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  27.44 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  36.87 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  34.91 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.67 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.49 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  36.36 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  38.05 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.65 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  35.75 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  30.05 
 
 
200 aa  72  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.81 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.46 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.14 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.69 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  33.73 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.92 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  34.86 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.2 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  36.63 
 
 
447 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.79 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.63 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  34.31 
 
 
439 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  35.91 
 
 
208 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.75 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.73 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  32.31 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
443 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.16 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.73 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.21 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.91 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1751  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.12 
 
 
315 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
443 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.5 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  34.31 
 
 
439 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.92 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.15 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  34.12 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.88 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.05 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.15 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.9 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.16 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  31.13 
 
 
287 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 
288 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.21 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  29.35 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.57 
 
 
316 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  31.13 
 
 
287 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.59 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.09 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  47.37 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.34 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.35 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.41 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.66 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.38 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.04 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2467  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.89 
 
 
340 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.226319  normal  0.866598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.57 
 
 
216 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.73 
 
 
190 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.36 
 
 
240 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.59 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>