58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0180 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  36.77 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.14 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  36.61 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  39.73 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  35.14 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  35.59 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  34.23 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  34.4 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  29.44 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  31.17 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  29.73 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  31.58 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  31.6 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  36.62 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  30.22 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  32.02 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.68 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  29.13 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  32 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  30.36 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.5 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.67 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  30.43 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  28.33 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.54 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.96 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  30.8 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  29.2 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  26.29 
 
 		 244 aa  85.9  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  28.12 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  29.44 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  27.23 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.71 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.51 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.91 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.15 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  30.69 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  31.78 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  28.72 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  26.55 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.03 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  32.3 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  30.53 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.01 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.86 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  32.67 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  32.67 
 
 		 447 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  32.67 
 
 		 443 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 		 443 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 		 439 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.94 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.32 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  23.25 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.05 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0842  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.27 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.77 
 
 		 228 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 		 221 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.685757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>