95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0892 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 
222 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  70.27 
 
 
226 aa  296  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  71.63 
 
 
231 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  68.3 
 
 
232 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  66.67 
 
 
223 aa  288  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  70.7 
 
 
225 aa  275  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  62.67 
 
 
232 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  68.49 
 
 
221 aa  267  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  65.3 
 
 
243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  64.38 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  60.89 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  61.33 
 
 
231 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  54.88 
 
 
222 aa  201  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  50.46 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.48 
 
 
229 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  36.65 
 
 
223 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  36.65 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  36.2 
 
 
223 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  34.08 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  41.36 
 
 
222 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 
225 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.67 
 
 
223 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.74 
 
 
222 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  40.09 
 
 
226 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  42.54 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  37.61 
 
 
226 aa  118  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  44.44 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  33.5 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  34.63 
 
 
225 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  33.18 
 
 
220 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  44.65 
 
 
223 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.7 
 
 
235 aa  98.6  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  30.18 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  30.84 
 
 
216 aa  92  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.09 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  32.08 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  32.86 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  37.67 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.63 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  32.7 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  36.04 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  36.06 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  33.17 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  37.5 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  34.13 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.37 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.68 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.32 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  36.56 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  27.56 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.62 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.73 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.69 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.47 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.73 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.91 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  29.56 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.79 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.18 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.15 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.11 
 
 
203 aa  58.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.94 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.85 
 
 
215 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.39 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.33 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.87 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.76 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  31.09 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  31.38 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.89 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.42 
 
 
198 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.86 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.85 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.91 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  30.53 
 
 
190 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  26.32 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.44 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.74 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.86 
 
 
198 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.18 
 
 
208 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.06 
 
 
206 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.37 
 
 
223 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  27.78 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.76 
 
 
205 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.61 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.92 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.39 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.15 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.14 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.37 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.41 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.77 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.74 
 
 
218 aa  41.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>