93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2055 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47.66 
 
 
221 aa  206  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.46 
 
 
228 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.02 
 
 
225 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  46.26 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  39.17 
 
 
216 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.81 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.17 
 
 
216 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.64 
 
 
198 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.24 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.46 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  34.3 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.14 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.79 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.82 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.4 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  31.09 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.3 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  31.31 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.2 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.56 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  32.58 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.16 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.05 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.39 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.09 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.26 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.42 
 
 
212 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.03 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.29 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.2 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.38 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.27 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.82 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  31.33 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.95 
 
 
201 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.94 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  30.26 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  30.59 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  29.47 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.03 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  25.93 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.9 
 
 
286 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.65 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  28.28 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.95 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.24 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  28.92 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  28.5 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.14 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  26.39 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.24 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.39 
 
 
198 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  26.87 
 
 
190 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.75 
 
 
255 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.28 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  29.41 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.26 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.28 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.81 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.88 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.29 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.41 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  27.62 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.36 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.95 
 
 
228 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  26.06 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.74 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  28.65 
 
 
221 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  25.62 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.7 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.86 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.53 
 
 
222 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.88 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.64 
 
 
244 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  27.8 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  26.49 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  27.68 
 
 
225 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  25.68 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.29 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  28.48 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.17 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.12 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.95 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.25 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  26.42 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.14 
 
 
243 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1458  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30 
 
 
98 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0822596  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.37 
 
 
270 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>