96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3365 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  86.43 
 
 		 199 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  84.92 
 
 		 199 aa  320  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  83.42 
 
 		 199 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  74.37 
 
 		 198 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7000  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  77.39 
 
 		 198 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  81.91 
 
 		 199 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  77.39 
 
 		 198 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  60.91 
 
 		 199 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2292  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  56.4 
 
 		 174 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  44.24 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31010  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  39.3 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  40.43 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.88 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  36.68 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0940  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.5 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2931  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.3 
 
 		 209 aa  118  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.53 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.64 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.51 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  34.57 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.71 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.22 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.7 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.19 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.6 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.22 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.32 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2309  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.14 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.07 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  31.52 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.28 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.52 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.11 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.89 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.97 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.98 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.62 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.78 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.11 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  33.33 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.22 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  28.86 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.11 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.52 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.95 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.2 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.05 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  29.33 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.79 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  35.29 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.07 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.8 
 
 		 316 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.73 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.82 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.56 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.42 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.44 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.7 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.67 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.93 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.43 
 
 		 286 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.4 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.01 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.03 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  27.07 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  27.17 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.26 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.65 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.15 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2766  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.99 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.18 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  28.24 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.92 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.37 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  25.12 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.46 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  29.47 
 
 		 867 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.04 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  28.74 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.84 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.06 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.82 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.05 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  27.32 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.81 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2767  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.63 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.97 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.9 
 
 		 275 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.21 
 
 		 190 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.71 
 
 		 210 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3247  hypothetical protein  26.86 
 
 		 234 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>