84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5815 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2453  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  66.95 
 
 		 248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2767  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  54.27 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5816  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.94 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.092389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50.45 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2766  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  53.55 
 
 		 244 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0819  hypothetical protein  49.76 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27600  predicted dinucleotide-binding enzyme  51.87 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.965799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1051  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  50 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0265  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.82 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.37 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.73 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47.54 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1814  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.9 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.657854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1528  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  45.59 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00536325  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0494  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  43 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308503  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3649  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.48 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.45 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3247  hypothetical protein  38.25 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  35.71 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.49 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.11 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.24 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent family protein  35.32 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2670  hypothetical protein  32.09 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4212  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.16 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2304  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.86 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.01 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3534  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.17 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.42 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0326  NADP oxidoreductase, coenzyme f420-dependent  29.91 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.535147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.45 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  25.48 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.52 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.17 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0498  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.58 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0838928  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  31.72 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3535  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.81 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2297  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.96 
 
 		 150 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.110896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3417  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.22 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6216  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.06 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.5 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04115  hypothetical protein  41.58 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04152  predicted protein  41.58 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.56 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.24 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  28.43 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.21 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.82 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.84 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.74 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.99 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0738  hypothetical protein  43.59 
 
 		 85 aa  62  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4863  hypothetical protein  43.59 
 
 		 85 aa  62  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2259  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.47 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.96 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.36 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6425  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.09 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1431  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.48 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.75 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5883  putative oxidoreductase  26.06 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.83 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5857  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.59 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  32.63 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.37 
 
 		 316 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.63 
 
 		 199 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent protein  30.73 
 
 		 182 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.53 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.95 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.21 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7403  hypothetical protein  27.54 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  24.88 
 
 		 867 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  29.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.7 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03940  predicted dinucleotide-binding enzyme  22.69 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.942236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  30.17 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  30.17 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  30.17 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  30.17 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  30.17 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0566  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  30.43 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.132391  hitchhiker  0.00110885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  41.38 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>