58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5227 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent protein  100 
 
 
182 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.98 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.97 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.01 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.71 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.71 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1370  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77619  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
251 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.52 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29 
 
 
316 aa  61.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.4 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  30.68 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  30.56 
 
 
236 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.91 
 
 
240 aa  58.2  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 
236 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5423  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.68 
 
 
257 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.21701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.73 
 
 
248 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4317  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.14 
 
 
241 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644244  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0414  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.47 
 
 
248 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167555  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.78 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  29.45 
 
 
190 aa  54.7  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.56 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.74 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.78 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  31.18 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.32 
 
 
203 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.22 
 
 
232 aa  51.2  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.72 
 
 
210 aa  51.2  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.19 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  28.32 
 
 
223 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.09 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.15 
 
 
221 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.64 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  28.8 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.21 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  27.37 
 
 
232 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.5 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.48 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  27.53 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  29.76 
 
 
294 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3858  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.98 
 
 
245 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  29.87 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  30 
 
 
214 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.37 
 
 
219 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.9 
 
 
222 aa  44.7  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  52.63 
 
 
228 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3452  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  43.75 
 
 
288 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.93 
 
 
244 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3131  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  46.81 
 
 
288 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0268659  normal  0.0786936 
 
 
-
 
NC_002936  DET1397  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  23.95 
 
 
359 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.392974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.83 
 
 
222 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3328  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  40.62 
 
 
288 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.53 
 
 
230 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4167  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.38 
 
 
245 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2497  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.94 
 
 
253 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  26.59 
 
 
311 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  26.51 
 
 
296 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0861  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.68 
 
 
289 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>