92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3502 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 267 aa  553  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  52.45 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09808  hypothetical protein  37.41 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  38.02 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  36.88 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  35.21 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  35.42 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3313  hypothetical protein  32.69 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1956  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  33.71 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  29.82 
 
 		 315 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.19 
 
 		 328 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  24.09 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.51 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.46 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.82 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.99 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.47 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.56 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  25.83 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  25.27 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.64 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.54 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  28.31 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  23.96 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  28.31 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  26.07 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.86 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  27.21 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  24.55 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  24.55 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.52 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  25.54 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  24 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.41 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.43 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.94 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.65 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  25.35 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  25.37 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  23.44 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  26.07 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.3 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  25.68 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  25 
 
 		 315 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  27.31 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  26.52 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  23.66 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  22.34 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  25.11 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  25.19 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  25.56 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  25.18 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.72 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  24.28 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  25.38 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.81 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.39 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.39 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  23.44 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  24.82 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  24.63 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.24 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.64 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  24.5 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.67 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  23.22 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  23.05 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  24.49 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  24.29 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  24.91 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  22.43 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  23.67 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  24.46 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  23.96 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.02 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  22.75 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.02 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  25.93 
 
 		 618 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.72 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  25.3 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  24.35 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  22.27 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0819  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.65 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  25.93 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0808  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.28 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  23.27 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  20.72 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3964  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>