101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4008 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  100 
 
 		 331 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  54.7 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  53.99 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  51.83 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  51.83 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  51.83 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  52.85 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13635  hypothetical protein  53.64 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.5110900000000004e-24  normal  0.0143504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  50.52 
 
 		 311 aa  229  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  47.13 
 
 		 308 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  48.93 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  49.62 
 
 		 296 aa  215  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  46.18 
 
 		 294 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  46.32 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  44.13 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  48.09 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  49.61 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  44.1 
 
 		 297 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  46.04 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.84 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  48.26 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47.56 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  47.67 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  43.61 
 
 		 618 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  46.95 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  45.11 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  41.53 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.41 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  46.04 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  44.5 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  43.7 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2978  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  48.09 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  42.25 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.72 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.8 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  35.77 
 
 		 299 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.94 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  30.89 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.94 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  33.99 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.56 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  35.47 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.71 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.46 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.53 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.79 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.03 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  29.28 
 
 		 285 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.97 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  34.92 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24690  hypothetical protein  32.95 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.72 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  23.75 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  26.46 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.65 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.65 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.94 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.13 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.21 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  34.39 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  28.47 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.69 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  35.13 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.15 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  29.78 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.19 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  29.73 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.78 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.41 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.41 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.7 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2157  hypothetical protein  30.7 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0752  hypothetical protein  30.7 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2586  hypothetical protein  30.7 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3082  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.7 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2027  putative NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.7 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1523  hypothetical protein  31.02 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0111992  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0819  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.88 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0808  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.51 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  21.74 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  22.34 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  27.6 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  24.53 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  20.2 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  20.2 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  24.54 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.77 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.82 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2313  putative coenzyme F420-dependent NADP oxidoreductase  32.12 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0120565  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  24.54 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3110  hypothetical protein  32.95 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2892  hypothetical protein  29.66 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.392824  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  27.61 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  23.36 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2043  lactate dehydrogenase  28.95 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  22.63 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0684452 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>