81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6619 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  546  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  52.45 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  38.58 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  38.26 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  37.16 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  34.21 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09808  hypothetical protein  34.88 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1956  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  35.38 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3313  hypothetical protein  32.18 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.06 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.52 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  27.07 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.37 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.94 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  25.72 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  25.72 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  26.86 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.07 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  26.86 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.1 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  28.35 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.8 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.68 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  27.59 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  25.55 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.6 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.41 
 
 		 288 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  26.52 
 
 		 315 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.18 
 
 		 307 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.56 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.8 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  27.23 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  28.16 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  26.77 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.49 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  23.86 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.61 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.44 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  24.03 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  24.91 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  24.62 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  25.27 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  24.44 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  27.44 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.45 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.17 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.1 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  23.59 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  22.4 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  24.48 
 
 		 313 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  26.61 
 
 		 618 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  28.71 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  24.48 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  24.48 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  26.12 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  24.1 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  27.34 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  23.36 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.68 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  24.25 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  26.56 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  28 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  24.29 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  21.09 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  24.81 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  26.47 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0574  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  24.29 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  27.23 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  24.35 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  22.06 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  23.51 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  24.28 
 
 		 268 aa  42  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>