88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3216 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  42.46 
 
 		 270 aa  197  9e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09808  hypothetical protein  41.46 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  40.4 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1956  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  40.32 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  37.16 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3313  hypothetical protein  38.34 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  36.88 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.06 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.16 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.69 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  27.97 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  27.97 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.55 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.34 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.56 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.97 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.73 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  25.58 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  27.65 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.66 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  25.1 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.95 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.81 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  27.57 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  26.79 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  27.16 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  27.17 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.27 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  24.9 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2448  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.24 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  27.85 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  25.5 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  25.37 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  25.19 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1643  hypothetical protein  27.84 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  28.91 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  25.35 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  25.7 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.48 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.48 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  30.1 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  25.64 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  30.73 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  25.1 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2313  putative coenzyme F420-dependent NADP oxidoreductase  25.65 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0120565  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  24.7 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  24.9 
 
 		 286 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  27.24 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.54 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  27.94 
 
 		 309 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  22.9 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  24.77 
 
 		 618 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  27.75 
 
 		 344 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  24.43 
 
 		 292 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  23.85 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  23.11 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  23.31 
 
 		 358 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  25.56 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.84 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  26.54 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0911  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.51 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  23.08 
 
 		 313 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  25.79 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  23.3 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  24.9 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  23.3 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.3 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0470  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.7 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0949  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.7 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  24.25 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0023  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.5 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  25.23 
 
 		 308 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  22.26 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  23.39 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3670  oxidoreductase domain-containing protein  36.14 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 347 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0574  hypothetical protein  25.28 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.45 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>