93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1643 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1643  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2892  hypothetical protein  63.09 
 
 
266 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.392824  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2313  putative coenzyme F420-dependent NADP oxidoreductase  57.81 
 
 
211 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0120565  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0099  oxidoreductase domain-containing protein  38.75 
 
 
297 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0725  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.33 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_705  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
290 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000337402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.09 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.981834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1878  hypothetical protein  36.53 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3715  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.18 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0367  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.78 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.288045  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2608  hypothetical protein  43.04 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0801  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  31.56 
 
 
285 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000364861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1787  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.98 
 
 
328 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0239  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.23 
 
 
290 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  0.808086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01320  hypothetical protein  36.68 
 
 
316 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0631  Domain of unknown function DUF2520  39.26 
 
 
319 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0159  hypothetical protein  38.75 
 
 
311 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1883  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.07 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2885  hypothetical protein  36.97 
 
 
296 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0140  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.11 
 
 
307 aa  95.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.14549  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0100  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.09 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.982227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0428  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 
296 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0324  putative cytoplasmic protein  39.23 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3427  putative cytoplasmic protein  37.45 
 
 
296 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1550  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.78 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5149  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  37 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4849  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  37 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4763  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  37 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1455  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  38.78 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0322  hypothetical protein  42.25 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0091  putative cytoplasmic protein  34.91 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2408  hypothetical protein  39.92 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0298  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.2 
 
 
306 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4719  hypothetical protein  39.62 
 
 
313 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8384  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  40.69 
 
 
295 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.841409  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0574  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  39.92 
 
 
304 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0437245  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1317  hypothetical protein  32.83 
 
 
295 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3372  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.58 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9161  putative cytoplasmic protein  38.5 
 
 
296 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0210  hypothetical protein  36.21 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.163931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3227  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.65 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  40.89 
 
 
618 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4284  hypothetical protein  38.21 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.04 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2147  hypothetical protein  32.43 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.687516  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1982  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.19 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3216  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5365  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  35.16 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.937795  hitchhiker  0.00190793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12870  hypothetical protein  34.84 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0057272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1956  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2173  hypothetical protein  31.18 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1101  hypothetical protein  37.77 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01781  hypothetical protein  36.7 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0566  Domain of unknown function DUF2520  35.1 
 
 
313 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2952  hypothetical protein  23.11 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.588576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3158  hypothetical protein  37.23 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1423  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase-like protein  37.44 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4980  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann-like domain protein  33.33 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0411301  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1098  hypothetical protein  29.65 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0336  hypothetical cytosolic protein  28.77 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4488  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.56 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1853  hypothetical protein  28.77 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1022  hypothetical protein  29.15 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000881326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0459  hypothetical protein  33.98 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0556  hypothetical protein  38.84 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0154  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000106629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13635  hypothetical protein  38.99 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.5110900000000004e-24  normal  0.0143504 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09808  hypothetical protein  28.4 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3050  hypothetical protein  27.46 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2907  hypothetical protein  27.05 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0574  hypothetical protein  22.31 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1788  hypothetical protein  26.89 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21472  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1611  hypothetical protein  26.09 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.575841  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2097  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.13 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1267  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.69 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6619  hypothetical protein  25.98 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35560  hypothetical protein  35.68 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0380353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3719  hypothetical protein  37.57 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3502  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  24.9 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458858  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0659  hypothetical protein  26.63 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.599675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4008  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  32.14 
 
 
331 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3016  hypothetical protein  21.9 
 
 
297 aa  62.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.77776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3475  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.38 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128821  normal  0.109237 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4547  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.38 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3313  hypothetical protein  27.22 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4572  hypothetical protein  36.16 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1320  hypothetical protein  22.58 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3111  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.98 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.727312  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1523  hypothetical protein  31.84 
 
 
332 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0111992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0634  Putative oxidoreductase/dehydrogenase, Rossmann- like domain protein  36.92 
 
 
344 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165538  normal  0.317687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0882  hypothetical protein  31.05 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32020  hypothetical protein  30.14 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4050  hypothetical protein  32.89 
 
 
309 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>