32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1080 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1080  phage integrase family protein  100 
 
 
482 aa  956    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3306  phage integrase family protein  31.91 
 
 
460 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1101  integrase family protein  29.84 
 
 
466 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.46 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.36 
 
 
420 aa  63.9  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  23.02 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  23.1 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.66 
 
 
432 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  27.57 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  22.18 
 
 
405 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  21.32 
 
 
414 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  23.14 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  26.14 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  25.41 
 
 
418 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  36.56 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  25.54 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  36.14 
 
 
422 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.76 
 
 
415 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  22.75 
 
 
414 aa  46.6  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  24.66 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  24.05 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  21.73 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  21.7 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  22.05 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  22.28 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.72 
 
 
402 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  24.06 
 
 
394 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.73 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  24.05 
 
 
418 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.18 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  25.4 
 
 
418 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  28.85 
 
 
278 aa  43.5  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>