More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3306 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3306  phage integrase family protein  100 
 
 
460 aa  906    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1101  integrase family protein  54.22 
 
 
466 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1080  phage integrase family protein  31.91 
 
 
482 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  31.01 
 
 
420 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  29.68 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  23.09 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  25.46 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.31 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  25.57 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.28 
 
 
406 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  31.62 
 
 
422 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  31 
 
 
419 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.62 
 
 
414 aa  106  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  25.52 
 
 
416 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  23.79 
 
 
415 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.3 
 
 
405 aa  103  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  29.52 
 
 
422 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  27.79 
 
 
411 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  30.37 
 
 
439 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.45 
 
 
413 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.4 
 
 
414 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.19 
 
 
402 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  27.52 
 
 
411 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  26 
 
 
404 aa  101  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  25.5 
 
 
417 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  27.52 
 
 
411 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  23.15 
 
 
409 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  25.06 
 
 
394 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  26.16 
 
 
404 aa  99.8  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  24.82 
 
 
414 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  23.46 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  23.63 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  25.43 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  25.62 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  26.62 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  26.56 
 
 
415 aa  96.7  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  25.47 
 
 
398 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  25.17 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.72 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  24.51 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.68 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  21.98 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  25.42 
 
 
409 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  29.62 
 
 
404 aa  94  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  26.59 
 
 
397 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25.31 
 
 
387 aa  93.6  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  23.88 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  26.13 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  22.78 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  24.82 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  23.63 
 
 
418 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  24.94 
 
 
413 aa  91.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  23.02 
 
 
395 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  22.76 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  26.24 
 
 
446 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  25.72 
 
 
402 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  25.93 
 
 
413 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  25.44 
 
 
404 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  25.23 
 
 
404 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  25.52 
 
 
403 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  24.83 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  24.31 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  24.82 
 
 
391 aa  87.8  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  25.06 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  23.17 
 
 
404 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  24.41 
 
 
412 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  22.22 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  27.83 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  27.83 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  25.76 
 
 
394 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  25.12 
 
 
395 aa  87.4  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.15 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  24.82 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  24.12 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  24.82 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  24.53 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  25.17 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  24.82 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  23.57 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  31.64 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  27.23 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  26.78 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  25.06 
 
 
404 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.06 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  25.34 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  22.37 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.34 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  30.2 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  23.86 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  22.71 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.45 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2957  integrase family protein  24.33 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  23.7 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.89 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.11 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1034  phage integrase  23.46 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.288738  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  24.04 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  23.87 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  22.94 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>