177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3229 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3229  Potassium-transporting ATPase  100 
 
 
183 aa  356  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4090  Potassium-transporting ATPase  44.78 
 
 
210 aa  131  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27040  K+-transporting ATPase, C subunit  50.52 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3780  potassium-transporting ATPase, C subunit  45.85 
 
 
227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3246  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.02 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1018  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.5 
 
 
196 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.54573  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1512  potassium-transporting ATPase, C subunit  55.74 
 
 
203 aa  114  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.57 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  41.11 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  39.78 
 
 
218 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1877  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.11 
 
 
206 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.571443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04385  potassium-transporting ATPase subunit C  43.6 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.49 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  41.08 
 
 
189 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  38.19 
 
 
200 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.8 
 
 
195 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  35.64 
 
 
193 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6789  potassium-transporting ATPase, C subunit  36.84 
 
 
216 aa  98.2  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.160019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  39.44 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0832  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.25 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.31 
 
 
190 aa  98.2  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  39.68 
 
 
201 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3614  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.07 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  hitchhiker  0.000228688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  40.96 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  39.42 
 
 
201 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.5 
 
 
202 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3714  K+-transporting ATPase subunit C  43.85 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.34 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  34.76 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1706  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.43 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.341936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  39.23 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.5 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0253  Potassium-transporting ATPase  35.8 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  34.27 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  42.86 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3971  potassium-transporting ATPase subunit C  32.31 
 
 
199 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0485598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.83 
 
 
191 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1438  K transporting ATPase KdpC subunit  60 
 
 
309 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  36.04 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  38.12 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  38.12 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  37.81 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1153  potassium-transporting ATPase subunit C  35.45 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0117976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  38.46 
 
 
201 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  37.91 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4761  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  68.06 
 
 
285 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203467  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.22 
 
 
189 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  38.67 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2506  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.36 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.318419  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0723  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.08 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1973  potassium-transporting ATPase subunit C  36.07 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  36.36 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  37.62 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0289  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.57 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.238341 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.71 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1192  potassium-transporting ATPase subunit C  32.65 
 
 
199 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0435  K+-transporting ATPase c chain-like protein  66.2 
 
 
290 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  39.01 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  40.88 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  38.12 
 
 
193 aa  87.8  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  39.56 
 
 
207 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  36.08 
 
 
201 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  38.54 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4159  potassium-transporting ATPase subunit C  34.74 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  39.36 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  36.87 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  29.74 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  34.92 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1984  potassium-transporting ATPase subunit C  40.65 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0143266  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  29.74 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1709  potassium-transporting ATPase subunit C  34.74 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  36.7 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  37.71 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4606  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  62.34 
 
 
289 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  35.96 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  34.39 
 
 
190 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  35.64 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  35.43 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  34.39 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  35.29 
 
 
206 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  34.39 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.43 
 
 
196 aa  84.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4228  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  61.04 
 
 
289 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4294  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  61.04 
 
 
289 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  34.62 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3285  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  59.46 
 
 
298 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00212969  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  29.95 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  38.2 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  34.62 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  36.46 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.06 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.17 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  34.07 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  34.62 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3484  potassium-transporting ATPase subunit C  36.13 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744488  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  36.05 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0602  K transporting ATPase KdpC subunit  63.24 
 
 
302 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  36.05 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  38.2 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  37.22 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>