178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2202 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  97.41 
 
 
193 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  94.3 
 
 
193 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  93.78 
 
 
193 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  92.75 
 
 
193 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  92.75 
 
 
193 aa  360  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  90.67 
 
 
193 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  82.38 
 
 
193 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  81.35 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  81.35 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  81.35 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  81.35 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  81.35 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  81.35 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  81.35 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  75.4 
 
 
192 aa  294  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  73.26 
 
 
192 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  69.11 
 
 
193 aa  265  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  64.67 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  64.67 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  63.1 
 
 
193 aa  242  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  63.3 
 
 
191 aa  236  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  64.67 
 
 
203 aa  234  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  59.36 
 
 
189 aa  231  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  63.98 
 
 
206 aa  231  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  63.39 
 
 
204 aa  228  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  61.66 
 
 
193 aa  223  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  61.17 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  56.32 
 
 
191 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  59.36 
 
 
811 aa  211  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  62.77 
 
 
196 aa  207  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  60.96 
 
 
191 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  57.45 
 
 
189 aa  205  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  54.73 
 
 
201 aa  201  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  54.89 
 
 
189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  60.23 
 
 
206 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  60.23 
 
 
206 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  55.05 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  54.55 
 
 
201 aa  197  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  58.51 
 
 
220 aa  197  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  53.43 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  54.04 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  53.03 
 
 
200 aa  195  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.89 
 
 
189 aa  195  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  55.05 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  53.03 
 
 
201 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.89 
 
 
190 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.79 
 
 
190 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  52.79 
 
 
201 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  59.89 
 
 
207 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  59.89 
 
 
207 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  50.53 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6336  potassium-transporting ATPase subunit C  50.53 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  0.0440126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  56.78 
 
 
201 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  51.5 
 
 
201 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  55.38 
 
 
194 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  54.84 
 
 
194 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  52.33 
 
 
191 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  54.84 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  54.84 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  50 
 
 
189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  54.3 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.38 
 
 
189 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.91 
 
 
189 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3228  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.37 
 
 
189 aa  174  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0893  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.55 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  53.16 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0722  potassium-transporting ATPase subunit C  54.1 
 
 
190 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00653  potassium-transporting ATPase subunit C  54.1 
 
 
190 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2575  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.13 
 
 
197 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00644  hypothetical protein  54.1 
 
 
190 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1208  potassium-transporting ATPase subunit C  48.94 
 
 
191 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2940  potassium-transporting ATPase, C subunit  54.1 
 
 
190 aa  168  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2960  potassium-transporting ATPase subunit C  54.1 
 
 
190 aa  168  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  44.79 
 
 
198 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.46 
 
 
185 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  53.55 
 
 
190 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  53.55 
 
 
190 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 
197 aa  165  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  52.66 
 
 
205 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  53.01 
 
 
190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.18 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5360  potassium-transporting ATPase subunit C  52.38 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.985584  normal  0.054926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1157  potassium-transporting ATPase  52.94 
 
 
193 aa  160  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  49.02 
 
 
233 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  47.87 
 
 
218 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3246  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.73 
 
 
198 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2851  potassium-transporting ATPase, C subunit  53.67 
 
 
209 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  50 
 
 
191 aa  154  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5924  potassium-transporting ATPase, C subunit  48.53 
 
 
244 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1466  potassium-transporting ATPase, C subunit  49.74 
 
 
196 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101256  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  43.32 
 
 
193 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0626  potassium-transporting ATPase subunit C  42.47 
 
 
192 aa  153  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>